可以
开源期刊上发表的论文不代表都是低质量的论文，很多国际知名学术期刊都是开源期刊，比如nature communications等!区别就是文章接收后你需要缴纳论文处理费(article processing chargeAPC)，也就是版面费，然后你的文章就开放获取(Onen Access.OA)了，全球可免费下载!在开源期刊上发表论文是肯定不影响申请国外博士的，因为开放获取是国外机构一直鼓励的行为，很多知名教授都是这种方式发表文章。国外很多基金机构要求所资助的项目必须以这种方式发表论文。
博士就读的院校不同，毕业时被要求发sci的篇数不同，一股来说，大部分院校对于博士提出发1-3篇sci论文的要求，只要发够就可以毕业。但不是所有的博士发够3篇sci就一定能毕业。还有的单位直接要求博士发5篇以上sci才能毕业的。所以说被要求发1-3 sci论文就能毕业的博士，比起发至少5篇的博士来说，是幸福的，成功毕业的几率更高。
我国博十越来越难毕业，主要原因就是因为博十毕业被要求发sci，甚至还不止1篇。对干博十本人来说，发一篇sci就已经不容易，发表多篇，难度更大。更别说在发sci的基础上，增加条件，比如要发一区的多少篇、二区的多少篇，甚至还要求选择的sci刊物影响因子在多少以上。这些条件的限定，进一步增加了博十发sci的难度。简单一句话，博十想要毕业，必须会发sci。如果自己发sci有困难，就找专业人为自己指导，而且越早的开始笔备，毕业的几率就越多。