论文查重，在上传查重系统检测时，是全文上传的。通常论文查重也是全文内容都需要查重，但查重重点一般为论文正文内容，部分高校会明确规定只查重论文正文，对于这种情况，学术不端论文查重时仅需上传论文正文即可。根据论文的章节分章之后，在各章节分别检测查重，得出章节查重率，以及全文查重率。章节区分一般以论文的目录为基准，论文的目录、参考文献、摘等内容都可以被论文查重系统所识别。

首先一篇完整的毕业论文主要包括以下内容：封面、声明、中英文摘要、目录、主要符号对照表、正文、致谢、参考文献、附录、原创性声明或者授权声明、个人简历、导师简介、学习期间发表的学术论文等部分组成。其中正文部分，通常是由引文、摘要、各部分章节、总结等部分组成。大多数高校在每年毕业季时，都会统一发通知说明学校的毕业论文规范和查重说明，学校会统一下发论文样式等内容，一般会详细说明查重的范围。要是学校有具体的要求，那提交到学校的时候必须按照学校所要求的来哦。